Pendant les mois de mai à août, les eaux entourant l’île deviennent le foyer temporaire de diverses espèces de baleines, dont la majestueuse baleine à bosse. En effet, la région dispose d’eaux chaudes et riches en nutriments (poissons et plancton), ce qui en fait l’endroit idéal pour la reproduction de ces mammifères.

Des excursions en bateau spécialisé offrent une occasion unique d’observer ces géants dans leur habitat naturel, offrant des moments d’une beauté et d’une admiration sans pareilles. Le bateau part du canal de São Sebastião en direction de la pointe sud d’Ilhabela, et l’excursion dure environ cinq heures.